nginx/Windows работает с Win32 API (не эмуляция Cygwin). В качестве метода обработки соединений используется select, поэтому не стоит ожидать высокой производительности и масштабируемости: пока это бета-версия. На данный момент доступна практически вся функциональность, что и в nginx/Unix, за исключением XSLT-фильтра, встроенного perl'а и поддержки IPv6.
Инструкция по запуску под Windows
Наконец можно будет нормально поотлаживать и под Windows.